Diese klassifizieren nur zuverlässig auf die Hauptgruppen, jedoch nicht auf die Untergruppen des fäkalen Mikrobioms und sind daher wenig aussagekräftig. Zudem variiert das Mikrobiom in einer gesunden Population erheblich, wobei eine funktionelle Redundanz der verschiedenen Bakteriengruppen wichtig ist. Diversität allein sagt nicht viel aus über die Funktionalität des Mikrobioms.
Auch der Nachweis von Pilzen im Stuhl ist wenig relevant, denn „Pilze haben wir alle im Darm“, so Sandmann. Beim Versand des Stuhls von der Praxis ins Labor sterben zudem viele empfindliche Bakterien ab, während die robusten Pilze eher überleben – somit handelt es sich um ein prä-analytisches Problem.
G.-M. Ostendorf, Wiesbaden
